De andere 3 luchthavens in het Vlaamse Gewest zijn een pak kleiner dan de nationale luchthaven. Samen zijn ze goed voor enkele honderdduizenden passagiers. In 2023 ging het bij de luchthaven van Oostende-Brugge om iets meer dan 386.000 passagiers, bij de luchthaven van Antwerpen om bijna 260.000 passagiers. Voor Kortrijk-Wevelgem zijn er nog geen cijfers beschikbaar voor de periode 2020-2023. In 2019 telde die luchthaven ruim 62.000 passagiers.
De luchthaven van Oostende-Brugge is vooral gekend voor . De Antwerpse luchthaven specialiseert zich meer als intra-Europese zakenluchthaven. Kortrijk-Wevelgem wil zich ontwikkelen als regionale zakenluchthaven.
In vergelijking met 2022 steeg het aantal passagiers op de luchthavens van Antwerpen en Oostende-Brugge in 2023 met respectievelijk 5% en 8%. Ondanks die stijging lag het aantal passagiers op beide luchthavens nog 15% lager dan in 2019, het laatste jaar voor het begin van de Covid-19-crisis. In de periode voor 2020 kende het aantal passagiers in de luchthavens van Oostende-Brugge en Antwerpen een opvallende groei in 2016. Toen namen beide luchthavens een aantal vluchten over van de luchthaven van Zaventem, die een tijd gesloten was wegens de aanslagen van 22 maart 2016. Ook in de periode van 2017 tot 2019 telden de 2 luchthavens een groter aantal passagiers dan in de jaren voor 2016.